食源性疾病的病原物是指通过摄食，而进入人体的有毒有害物质的致病因子，所引起的疾病。食源性疾病的病原物，主要分为生物性病原物、化学性病原物、物理性病原物。首先，生物性病原物主要是指细菌，及其毒素、病毒、真菌、及其毒素，寄生虫及其虫卵。动植物存在的天然毒素，以及动植物食物储藏时，产生的毒性物质。其次，化学性病原物主要是指农药残留，有毒有害的化学物质等。后，物理性病原物，主要是指放射性物质的污染等。