花菜适合放冰箱冷藏保存，常温储藏容易导致水分流失和变质。花菜的储存方式主要与温度、湿度、保存时长、新鲜度、预处理方式等因素有关。
冰箱冷藏是花菜最理想的储存方式。将未清洗的花菜用保鲜膜包裹或放入保鲜袋中，置于冰箱冷藏室蔬菜格内，温度控制在0-4摄氏度，可保存5-7天。冷藏能有效抑制花菜呼吸作用和微生物繁殖，延缓维生素C等营养素的流失。注意冷藏前不要清洗，表面水分会加速腐败。若已切开，需将切口用保鲜膜包裹后再冷藏。
新鲜完整的花菜在阴凉通风处可短暂存放1-2天，适合立即食用的情况。室温超过20摄氏度时，花菜会快速失水萎蔫，花球松散，营养价值下降。夏季高温环境下，常温存放超过半天就可能出现黄变、发黏等变质现象。若发现花菜表面出现黑斑或异味，说明已变质不可食用。
无论冷藏或常温保存，都要注意湿度管理。花菜适宜的相对湿度为90-95%，湿度过低会导致花球脱水变黄，湿度过高易滋生霉菌。可在保鲜袋中垫入厨房纸吸收多余水分，或使用透气性较好的保鲜膜包裹，避免密封过严产生冷凝水。
清洗后的花菜必须彻底晾干表面水分才能冷藏，否则会加速腐败。切分后的花菜需尽快食用，切口处营养流失更快。焯水处理过的花菜需沥干冷却后密封冷冻，冷藏也只能保存1-2天。不建议将花菜与其他乙烯释放量大的水果如苹果、香蕉同放，会加速其老化。
完整未处理的花菜冷藏保质期最长，可达1周；切分后冷藏建议3天内食用；焯烫后冷藏不超过2天；煮熟的花菜只能冷藏1天。冷冻保存可延长至8-12个月，但解冻后口感会变软，适合用于炖煮类菜肴。不同品种的花菜储存性也有差异，松花菜比紧实型花菜更易变质。
花菜富含维生素C、维生素K、叶酸和膳食纤维，储存不当会造成这些营养素大量流失。建议购买时选择花球紧实、颜色洁白、茎部切口新鲜的产品，按需分装储存。日常可将花菜与胡萝卜、西蓝花等搭配烹饪，既丰富营养又提升菜肴色彩。对于已经轻微变黄的花菜，切除变色部分后尽快食用，烹调时适当加醋有助于保持色泽。特殊人群如胃肠功能较弱者，建议将花菜充分煮熟后食用，避免生冷刺激。
