豆芽的正确保存方法主要有冷藏保存、清水浸泡、沥干密封、避光处理和分装保存。
将新鲜豆芽装入保鲜袋或密封盒中，放入冰箱冷藏室4℃左右保存。低温能抑制豆芽呼吸作用，延缓腐烂变质，通常可保存2-3天。注意不要清洗豆芽后再冷藏，残留水分会加速霉变。若发现豆芽表面出现黏滑或异味应立即丢弃。
短期保存可将豆芽根部朝下直立浸泡在清水中，水量没过豆芽1/3即可。每天换水1-2次，保持水质清洁，室温下可保存1天。此方法适合即买即用的情况，但不宜超过24小时，否则豆芽会因吸水过多导致口感变差。
清洗后的豆芽需彻底沥干表面水分，用厨房纸吸干后放入透气性好的保鲜盒，盒内垫一层吸水纸。密封后冷藏可减少水分凝结，避免豆芽因潮湿发黏。注意容器不要完全密闭，留少许缝隙保持空气流通。
豆芽含叶绿素遇光会继续光合作用导致纤维老化。保存时应使用不透光容器或用深色袋子包裹，避免阳光或灯光直射。光照还会加速豆芽变绿和维生素C流失，避光保存能更好维持脆嫩口感和营养价值。
大量豆芽可按单次用量分装保存，避免反复开合包装造成污染。每份以100-200克为宜，用食品级密封袋抽真空后冷冻，可延长保存期至1周。冷冻豆芽解冻后适合炒制，凉拌会失去脆爽感。
豆芽作为高水分蔬菜，保存时需特别注意控制湿度和温度。日常建议现买现吃，如需保存优先选择冷藏法。购买时挑选茎部洁白挺直、无褐斑的豆芽，保存前去除腐烂部分。烹饪前用流水冲洗并焯水10秒，既能杀菌又能保持爽脆。脾胃虚寒者应控制食用量，腹泻期间不宜生食豆芽。合理保存能最大限度保留豆芽的维生素B族、维生素C和膳食纤维等营养成分。
