煮鸡蛋前建议清洗蛋壳表面。鸡蛋外壳可能沾染禽类粪便、泥土或沙门氏菌等污染物，清洗可降低烹饪过程中的污染风险，但需注意避免用力搓洗破坏蛋壳保护膜。
鸡蛋在运输储存过程中，蛋壳表面可能附着禽类排泄物、饲料残渣或环境中的细菌。沙门氏菌是常见食源性致病菌，可能通过蛋壳气孔渗入内部。用流动清水轻柔冲洗蛋壳30秒以上，能有效减少表面微生物数量。若蛋壳有明显污渍，可用软毛刷辅助清洁，但过度刷洗会导致蛋壳角质层脱落，反而增加细菌侵入概率。
部分市售预清洗蛋经过紫外线或食品级清洁剂处理，理论上无须重复清洗。但若鸡蛋存放时间较长或储存环境潮湿，烹饪前二次清洗更为稳妥。需注意清洗后应立即烹煮，避免水分破坏蛋壳保护层后加速变质。带裂纹的鸡蛋必须彻底清洗，但建议优先用于全熟烹饪方式。
日常处理鸡蛋时，建议购买正规渠道的清洁蛋，存放于冰箱冷藏室独立区域。烹饪前可佩戴一次性手套处理蛋壳，接触生鸡蛋后及时洗手。老人、孕妇及免疫力低下人群应确保鸡蛋完全煮熟，避免溏心蛋或单面煎蛋等半熟做法。蛋壳清洗后若暂不烹煮，可用厨房纸擦干表面水分后冷藏保存。
