西红柿可通过冷藏、常温通风、冷冻、制作酱料、真空密封等方式保存。不同保存方法适用于不同成熟度和用途的西红柿，合理选择能延长保鲜期并保留营养。
未完全成熟的青西红柿适合冷藏保存。将西红柿蒂朝下放置于冰箱冷藏室蔬果盒内，温度控制在4-8摄氏度，可减缓成熟速度并避免冻伤。冷藏可保存5-7天，但完全成熟的红西红柿冷藏后口感会变粉，建议尽快食用。
已成熟的西红柿应在阴凉通风处常温保存。平铺于竹篮或纸盒中，避免叠压和阳光直射，温度保持在15-22摄氏度最佳。此法可保留西红柿原有风味，但需在2-3天内食用完毕，否则易腐烂变质。
去皮切块的西红柿适合冷冻长期保存。将烫过去皮的西红柿切块装入密封袋，挤出空气后平铺冷冻。冷冻会使细胞结构改变，解冻后适合做汤酱，营养流失较少但口感变软，可保存3-6个月。
将熟透的西红柿熬煮成番茄酱或番茄膏可延长保质期。加入少量柠檬汁调节酸度，装瓶后高温杀菌密封，常温保存可达1年。自制酱料需注意消毒彻底，开封后需冷藏并尽快食用。
使用真空机抽除包装内空气能显著抑制氧化。完整或切块的西红柿真空密封后冷藏可保鲜10-15天，冷冻保存可达8个月。此法能最大程度保留维生素C和番茄红素，但需专业设备支持。
保存西红柿时需根据用途选择方法，生食建议常温或短期冷藏，烹饪用途可冷冻或加工。避免将西红柿与香蕉、苹果等释放乙烯的水果同放，定期检查剔除腐烂果实。无论采用何种方法，表皮完整无损伤的西红柿保存效果更佳，清洗后需彻底晾干再储存。对于大量西红柿，可组合使用多种保存方式以兼顾风味与时效。
