香菇建议冷藏保存，短期存放可置于阴凉通风处。香菇的保存方式主要取决于存放时间、环境湿度及新鲜度，冷藏能有效延缓腐败变质，常温保存仅适用于干燥环境且3天内食用完毕的情况。
冷藏环境下香菇的细胞活性降低，微生物繁殖速度减缓，可保存5-7天。需用透气保鲜袋包裹防止冷凝水积聚，避免与气味强烈的食物混放。冷藏前切除菌柄底部木质化部分，保留菌褶完整能减少营养流失。若发现菌盖变软或出现黏液应立即丢弃。
常温保存需保持环境干燥通风，温度不超过20摄氏度。未清洗的整朵香菇可平铺于竹篮中，覆盖干净纱布防尘。夏季高温潮湿环境下，常温存放超过12小时即可能滋生霉菌。切开或破损的香菇必须冷藏，常温下易被黄曲霉菌污染产生毒素。
无论采用何种保存方式，建议购买后尽快食用以确保最佳风味。烹饪前检查菌盖是否完整、有无异味，避免食用变质香菇。日常可将香菇制成干品或腌制品延长保质期，泡发时用温水可最大限度保留鲜味物质。搭配富含维生素C的蔬菜食用有助于提高香菇多糖的吸收率。
