新鲜小米椒在常温下通常可保存3-5天，冷藏可延长至1-2周，冷冻保存可达3个月以上。保存时间受储存方式、环境湿度、果实完整度等因素影响。
完整未破损的小米椒在阴凉通风处可存放3-5天。建议摊开置于竹篮或透气的纸盒中，避免阳光直射和潮湿环境。若发现果实变软或表皮皱缩，需立即食用或转移至冷藏环境。夏季高温时建议优先选择冷藏保存。
用厨房纸包裹后放入保鲜袋冷藏，可维持1-2周新鲜度。注意保持袋内干燥并留出透气孔，避免冷凝水导致霉变。冷藏后的小米椒辣味会略有降低，适合直接用于烹饪，不建议再转为常温储存。
洗净擦干后整颗密封冷冻，可保存3个月以上。冷冻会使果肉细胞破裂，解冻后更适合制作辣椒酱或炖煮类菜肴。也可切碎分装成小份冷冻，使用时直接取用无需解冻，但风味会随时间逐渐减弱。
穿绳悬挂晾干或使用食品烘干机制成干辣椒，在密封避光条件下可储存6-12个月。干燥过程会使辣味更浓郁，但维生素C等热敏性营养素会有部分流失，适合长期备餐或制作香料使用。
通过泡制辣椒酱、醋渍或油浸等方式可延长保存期至3-6个月。加工时需确保容器高温消毒，并保持酱料完全浸没辣椒。自制加工品应冷藏存放，开封后建议1个月内食用完毕。
建议根据食用频率选择合适保存方式，短期内食用可选择冷藏保持鲜度，长期保存推荐冷冻或干燥处理。无论采用何种方式，储存前需剔除破损果实，避免交叉污染。冷冻小米椒使用时可直接投入热锅，无需解冻以保持质地；干燥辣椒使用前可温水浸泡恢复部分柔软度。定期检查储存容器，发现霉变应立即丢弃整批食材。
