土豆发芽通常可以通过低温避光储存、隔绝氧气、避免损伤、定期检查、使用天然抑芽剂等方法预防。发芽的土豆可能产生龙葵碱等有毒物质，建议丢弃处理。
将土豆存放在5-8摄氏度的阴凉环境中能有效延缓发芽。地下室或冷藏室抽屉是理想选择，但需避免温度低于4摄氏度以防淀粉转化影响口感。储存时可用黑色塑料袋包裹隔绝光线，同时保持适度通风防止霉变。
采用真空密封或充氮包装能阻断土豆呼吸作用。家庭可用保鲜膜紧密包裹后放入密封盒，或在储存容器底部铺干燥的沙土、木屑等吸湿材料，减少氧气接触。注意定期更换吸湿材料防止霉变。
收获和运输过程中需轻拿轻放，表皮完整的土豆更耐储存。挑选时剔除有机械伤、虫蛀或腐烂的个体。储存前无须清洗，保留表层泥土能形成天然保护层，使用前再清洁即可。
每两周翻检一次储存的土豆，及时移除开始软化或表皮皱缩的个体。发芽初期芽眼处会出现微小凸起，此时立即挖除芽眼及周围组织仍可食用，但需彻底加热破坏残留毒素。
将苹果或香蕉与土豆混放，其释放的乙烯气体可抑制发芽。也可在储存容器中放入晒干的薄荷叶、月桂叶等芳香植物，或撒少量食品级活性炭吸附促芽物质。这些方法安全无残留，适合家庭使用。
除储存方法外，建议购买时选择晚熟品种的土豆，其休眠期较长不易发芽。少量多次采购、优先食用小个头土豆也能减少储存压力。已轻微发芽的土豆可切除芽眼及周围2厘米组织后高温烹煮，但出现大面积变绿或发芽超过3天应整颗丢弃。长期储存可考虑将土豆切块焯水后冷冻，或制成薯干等加工品。保持储存环境干燥清洁，避免与洋葱等易腐蔬菜混放，能显著延长保鲜期。
