咖啡渣可以直接作为肥料使用，但需经过堆肥处理或与其他材料混合。咖啡渣含有氮、磷、钾等营养元素，适合用于改善土壤结构、促进植物生长。使用方式主要有堆肥发酵、直接浅埋、与草木灰混合等。
将咖啡渣与枯叶、厨余垃圾等混合堆肥，可加速有机物分解。咖啡渣属于高氮材料，需搭配高碳材料如干草或纸屑平衡碳氮比。堆肥过程中定期翻动，约2-3个月后腐熟完成，能有效避免烧根风险并提升肥效。
少量咖啡渣可直接在植物周围挖沟浅埋，深度不超过5厘米。此法适合酸性喜好的植物如杜鹃、蓝莓，但需控制用量，每平方米不超过500克。新鲜咖啡渣可能抑制种子发芽，建议用于成年植株。
咖啡渣与草木灰按3：1比例混合，可中和酸性并补充钾元素。混合后静置一周，撒施于蔬菜或花卉根部周围。此方法能预防土壤板结，特别适合番茄、辣椒等结果类作物，但需避开幼苗期使用。
咖啡渣与水按1：10比例密封浸泡7天，过滤后稀释10倍作为叶面肥。含有的咖啡因可驱避蚜虫等软体害虫，每周喷施一次能促进叶片油亮。需避免在正午高温时使用，防止叶片灼伤。
将干燥咖啡渣作为蚯蚓养殖床的添加材料，占比不超过20%。咖啡渣的粗纤维能促进蚯蚓肠道蠕动，其含有的多糖物质可增加蚯蚓粪肥的保水性。需确保咖啡渣无奶精等添加剂残留。
使用咖啡渣肥料时需注意：新鲜咖啡渣pH值约4.5-5.5，过量使用可能导致土壤过酸，建议每月施用不超过2次。对于碱性土壤植物如甘蓝、菠菜，应与石灰粉交替使用。咖啡渣肥料更适合观叶植物、茄科作物及多年生花卉，对多肉植物等耐贫瘠品种效果有限。存放时应保持干燥，霉变的咖啡渣可能滋生青霉菌等有害微生物。初次使用前可先在小范围植株试验，观察1周无不良反应再大面积推广。
