清洗香菇时先用流动水冲洗表面污垢，再用淡盐水浸泡10分钟可有效去除杂质。清洗方法主要有流水冲洗、盐水浸泡、淀粉搓洗、小苏打清洗、刀具修整等。
将香菇伞盖朝下置于流动清水下，用手指轻轻搓洗褶皱处。水流压力不宜过大，避免破坏香菇肉质。伞柄底部容易积存木屑，需重点冲洗连接处。此方法适合处理表面附着松散泥土的新鲜香菇。
取5克食盐溶解于500毫升清水中，放入香菇浸泡8-10分钟。盐分能促使褶皱中的虫卵浮出，同时破坏部分微生物细胞结构。浸泡后需再次用流水冲洗，避免盐分残留影响口感。该方法对人工栽培的香菇效果更显著。
在湿润的香菇表面撒少量马铃薯淀粉，轻轻揉搓伞盖褶皱。淀粉颗粒的吸附作用可带走隐蔽处的泥沙，完成后用冷水冲净。此方式特别适合清洗野生香菇，能去除附着较紧的森林腐殖质。
每升清水添加3克食用小苏打，浸泡香菇5分钟后刷洗。碱性环境能分解部分农药残留，但浸泡时间过长会导致香菇变软。该方法适用于怀疑有化学污染的香菇，处理后需彻底冲洗。
用陶瓷刀削除伞柄底部木质化部分，该部位常携带培养基残渣。对于干香菇，需先剪除硬质柄端再泡发。刀具处理可减少后续清洗难度，同时提升食用时的口感体验。
清洗后的香菇应尽快烹饪，避免长时间浸泡导致营养流失。野生香菇建议延长清洗时间，必要时可焯水处理。储存时保持干燥通风，冷藏保存不宜超过3天。选择香菇时注意观察伞盖是否完整，避免选购表面黏液过多的变质产品。日常食用每次建议控制在100-150克，过敏体质者初次食用需少量尝试。
