长期严格吃素可能缺乏优质蛋白、维生素B12、铁、钙、锌等营养素。素食者需特别注意通过合理搭配食物补充这些营养素，避免因饮食结构单一导致营养失衡。
植物性食物中大豆及其制品是优质蛋白的重要来源，但其他植物蛋白多为不完全蛋白，缺乏某些必需氨基酸。建议素食者每日搭配豆类、坚果、全谷物等多种植物蛋白来源，通过食物互补作用提高蛋白质利用率。发酵豆制品如纳豆、天贝等可进一步提升蛋白质吸收率。
维生素B12几乎只存在于动物性食品中，长期缺乏可能导致恶性贫血和神经系统损伤。严格素食者需定期检测血清维生素B12水平，可通过强化食品如营养酵母、植物奶或医生指导下的补充剂获取。部分藻类虽含类似物质但生物利用率较低。
植物性铁为非血红素铁，吸收率仅为动物性铁的十分之一左右。深色蔬菜、豆类、坚果虽含铁丰富，但需搭配维生素C丰富的食物促进吸收。饮茶或咖啡时间应与补铁餐间隔两小时以上，避免单宁酸抑制铁吸收。女性素食者更需关注铁营养状况。
传统观念认为乳制品是钙的最佳来源，但素食者可通过食用芝麻、杏仁、羽衣甘蓝等富钙植物获取。部分蔬菜如菠菜含草酸较高会影响钙吸收，建议焯水后食用。钙强化豆奶和豆腐也是重要补充途径，每日应保证足够日照促进维生素D合成以帮助钙利用。
全谷物和豆类含锌量较高，但植酸会显著抑制锌的吸收。发芽、浸泡或发酵处理可降低植酸含量，如选择发芽谷物、味噌等发酵食品。南瓜籽、腰果等坚果也是锌的良好来源，建议与富含有机酸的食物同食提升生物利用率。
素食者应建立科学的膳食结构，每日摄入足量豆制品、全谷物、坚果种子、深色蔬菜和水果。定期进行营养状况评估，必要时在专业指导下使用营养补充剂。注意采用浸泡、发酵等烹饪方式提升矿物质吸收率，合理搭配维生素C丰富的食物促进铁吸收。保持食物多样性是预防营养缺乏的关键，特殊生理阶段如孕期、哺乳期或生长发育期需更加重视营养均衡。
